Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RubcnlQ3TD16 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms