Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms