Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Shroom4Q1W617 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms