Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samd11Q1RNF8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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