Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rab42Q0PD08 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms