Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Neurl1bQ0MW30 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms