Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnn2Q08093 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms