Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Siah1bQ06985 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms