Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cxcr5Q04683 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cxcr5Q04683 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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