Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfiaQ02780 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms