Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cacna1cQ01815 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms