Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grin2bQ01097 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Grin2bQ01097 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms