Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
SgcdP82347 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SgcdP82347 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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