Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Irx3P81067 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Irx3P81067 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms