Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nphp4P59240 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms