Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Samsn1P57725 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms