Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxc13P50207 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxc13P50207 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Hoxc13P50207 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc13P50207 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Hoxc13P50207 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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