Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ItgavP43406 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ItgavP43406 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms