Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LtbP41155 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LtbP41155 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LtbP41155 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LtbP41155 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LtbP41155 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LtbP41155 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LtbP41155 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LtbP41155 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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LtbP41155 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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LtbP41155 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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LtbP41155 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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LtbP41155 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LtbP41155 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LtbP41155 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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LtbP41155 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LtbP41155 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LtbP41155 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms