Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ddit3P35639 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddit3P35639 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms