Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6dP35459 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms