Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Apoc3P33622 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms