Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtprmP28828 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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