Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxd10P28359 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Hoxd10P28359 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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