Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ChgaP26339 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms