Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb7P26011 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb7P26011 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb7P26011 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb7P26011 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb7P26011 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Itgb7P26011 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb7P26011 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb7P26011 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb7P26011 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb7P26011 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb7P26011 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb7P26011 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb7P26011 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Itgb7P26011 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms