Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ggta1P23336 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ggta1P23336 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ggta1P23336 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ggta1P23336 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Ggta1P23336 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ggta1P23336 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms