Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a1P19437 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms