Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sdc1P18828 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms