Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Defa1P11477 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms