Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxb7P09024 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxb7P09024 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms