Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp4O70480 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms