Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DffaO54786 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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DffaO54786 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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DffaO54786 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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DffaO54786 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DffaO54786 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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DffaO54786 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DffaO54786 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffaO54786 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DffaO54786 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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DffaO54786 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffaO54786 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffaO54786 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffaO54786 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffaO54786 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
DffaO54786 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms