Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CltaO08585 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CltaO08585 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CltaO08585 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CltaO08585 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltaO08585 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltaO08585 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltaO08585 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltaO08585 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltaO08585 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltaO08585 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CltaO08585 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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