Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Efna3O08545 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Efna3O08545 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Efna3O08545 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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