Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MsmbO08540 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MsmbO08540 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
MsmbO08540 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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