Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm20918J3QN17 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm20918J3QN17 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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