Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Crocc2F6XLV1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Crocc2F6XLV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms