Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm28305F6U473 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28305F6U473 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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