Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm29094F6Q785 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm29094F6Q785 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms