Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
ApobE9Q414 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
ApobE9Q414 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
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