Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Ube2d4D3YUH6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms