Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cttnbp2B9EJA2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cttnbp2B9EJA2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms