Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Clip3B9EHT4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Clip3B9EHT4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms