Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ppfia4B8QI36 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ppfia4B8QI36 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms