Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
PtprbB2RU80 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
PtprbB2RU80 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms