Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Brpf1B2RRD7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms