Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC035947B2RQY6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms