Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp42B2RQC2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp42B2RQC2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms