Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cldn34c4A2ANA3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cldn34c4A2ANA3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms